Sello pyme innovadora

Alberto Hospital Premoney
Alberto Hospital
July 17, 2026
5 min read
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El Sello Pyme Innovadora es una certificación oficial que otorga el Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades a las pymes que acreditan carácter innovador. El trámite es telemático y gratuito, pero su valor no está en el reconocimiento: está en lo que desbloquea fiscalmente. Es la llave que permite compatibilizar las deducciones fiscales por I+D+i con las bonificaciones en la Seguridad Social por personal investigador, dos incentivos que, sin el sello, son excluyentes.

En esta guía te contamos qué es exactamente, qué requisitos exige, cuánto puedes ahorrar y cómo solicitarlo paso a paso.

Si estás planteando solicitar el sello de pyme innovadora o cualquier instrumento de financiación pública, escríbenos y te ayudamos.

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¿Qué es el Sello Pyme Innovadora?

Es una certificación regulada por la Orden ECC/1087/2015 que acredita oficialmente el carácter innovador de una pyme y la inscribe en el Registro de Pyme Innovadora, un registro público gestionado por el Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades.

Una vez concedido, la empresa puede utilizar el logotipo oficial del sello con fines comerciales y acceder a los beneficios fiscales y financieros que veremos más abajo.

¿Para qué sirve realmente el sello?

Aquí está la clave que muchas empresas desconocen.

Por defecto, una empresa con personal investigador debe elegir entre dos incentivos: aplicar la deducción fiscal por I+D+i del artículo 35 de la Ley del Impuesto sobre Sociedades, o aplicar la bonificación del 40% en las cotizaciones sociales de ese personal. No puede usar ambas sobre el mismo trabajador.

Con el Sello Pyme Innovadora, sí: la empresa puede aplicar la bonificación en la Seguridad Social y la deducción fiscal a la vez, sobre el mismo personal investigador. Para una startup con dos o tres perfiles técnicos dedicados a I+D, esta compatibilidad puede suponer decenas de miles de euros al año entre ahorro fiscal y ahorro en cotizaciones.

Requisitos para obtener el Sello Pyme Innovadora

La empresa debe cumplir dos condiciones:

1. Ser una pyme según la definición europea: menos de 250 empleados y un volumen de negocio anual que no supere los 50 millones de euros o un balance general anual que no supere los 43 millones.

2. Acreditar su carácter innovador. Basta con cumplir una sola de las siguientes vías:

Vía 1: Haber recibido financiación pública de I+D+i en los últimos 3 años

A través de convocatorias del Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación, ayudas del CDTI (como Neotec o los proyectos de I+D) o programas europeos como Horizonte Europa.

Vía 2: Demostrar actividad innovadora propia

Con una patente propia en explotación registrada en los últimos 5 años, o con un Informe Motivado Vinculante positivo emitido en alguno de los 3 ejercicios anteriores, a efectos de la deducción del artículo 35 de la LIS.

Vía 3: Contar con una certificación oficial de innovación

Certificación de Joven Empresa Innovadora (especificación AENOR EA0043), de Pequeña o Microempresa Innovadora (AENOR EA0047) o de sistema de gestión de la I+D+i según la norma UNE 166.002.

Además, para formalizar la solicitud la empresa debe estar al corriente de sus obligaciones con Hacienda y con la Seguridad Social, y no haber sufrido la revocación de ayudas públicas recibidas anteriormente.

Ventajas del Sello Pyme Innovadora

Bonificación del 40% en la Seguridad Social

Reducción del 40% de la cuota empresarial por contingencias comunes de los trabajadores investigadores con dedicación exclusiva a actividades de I+D+i (se admite hasta un 15% de su jornada en tareas de formación o divulgación).

Es ahorro en liquidez mes a mes, no una deducción que se aplica una vez al año.

Compatibilidad con las deducciones fiscales por I+D+i

Gracias al sello, la bonificación anterior se puede compatibilizar con la deducción del artículo 35 de la LIS: hasta un 25% de los gastos de I+D (42% sobre el exceso respecto a la media de los dos ejercicios anteriores, más un 17% adicional por personal investigador exclusivo) y un 12% de los gastos de innovación tecnológica. Tienes el detalle completo en nuestra guía de deducciones fiscales por I+D+i.

Acceso preferente a financiación pública

Determinadas líneas de ayuda y financiación, como las del ICO o convocatorias del CDTI, contemplan condiciones especiales o acceso directo para empresas inscritas en el Registro de Pyme Innovadora.

Participación en la Compra Pública de Innovación

El sello habilita a la empresa para participar en licitaciones públicas reservadas a pymes innovadoras, una vía de negocio cerrada para el resto.

Valor comercial y reputacional

El logotipo oficial puede usarse con fines publicitarios y comerciales: refuerza la imagen de la empresa ante clientes, inversores y socios, y funciona como señal de calidad en procesos de due diligence.

Cómo solicitar el Sello Pyme Innovadora paso a paso

El proceso es 100% telemático y sin coste, a través de la sede electrónica del Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. La resolución puede tardar desde unas semanas hasta varios meses, según el volumen de solicitudes.

Paso 1: Alta en el sistema SISEN

La empresa y su representante legal deben estar dados de alta en el Sistema de Información de la Secretaría de Estado de Investigación (SISEN) antes de iniciar la solicitud.

Paso 2: Preparar la documentación

  • Declaración responsable del tamaño de empresa: número de empleados, facturación y balance del último ejercicio cerrado.
  • Certificado de estar al corriente con Hacienda.
  • Certificado de estar al corriente con la Seguridad Social.
  • Documentación que acredite el criterio de innovación: resolución de la ayuda, informe motivado, patente o certificado AENOR.

Paso 3: Presentar la solicitud

Se presenta telemáticamente en la sede electrónica. El Ministerio verifica los requisitos y, si todo es correcto, inscribe a la empresa en el Registro de Pyme Innovadora y le concede el sello.

¿Cuánto dura el sello y cómo se renueva?

La vigencia depende del criterio con el que se obtuvo: 3 años si se acreditó mediante ayudas públicas o Informes Motivados, 5 años si fue mediante patente, y el período de validez de la certificación en el caso de los certificados AENOR.

La buena noticia: si durante ese tiempo la empresa obtiene una nueva ayuda pública, un nuevo Informe Motivado positivo o una nueva patente, la fecha de validez del sello se actualiza automáticamente, sin trámite adicional.

Lo que hay que evitar a toda costa es dejarlo caducar. Perder el sello implica perder la compatibilidad entre deducciones fiscales y bonificaciones de Seguridad Social, con el sobrecoste que eso supone desde el primer mes.

Preguntas frecuentes

¿Cuánto cuesta obtener el Sello Pyme Innovadora?Nada. El trámite ante el Ministerio es gratuito. El coste real, si lo hay, está en obtener el requisito habilitante (por ejemplo, un Informe Motivado Vinculante o una certificación AENOR).

¿Una startup recién constituida puede solicitarlo?Sí, siempre que cumpla alguno de los criterios de innovación. Por ejemplo, si ha obtenido un Neotec del CDTI o financiación de Horizonte Europa, ya cumple la vía de financiación pública.

¿Dónde puedo comprobar si una empresa tiene el sello?En el Registro de Pyme Innovadora, de consulta pública en la web del Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades.

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